Родился 1 сентября 1950 года.
Сразу после школы, в 1972 году устроился на предприятие «Каспморнефть» буровиком, где прошел профессиональный путь до заместителя начальника нефтепромысла.
В 1974 г. окончил Азербайджанский институт нефти и химии им. М. Азизбекова.
Был направлен в западносибирский г. Сургут, где работал сначала старшим инженером нефтепромысла, затем – его начальником, после чего возглавил Центральную инженерно-технологическую службу.
В 1983 году Вагит Алекперов получил назначение в Когалым. Проработав первым заместителем генерального директора «Башнефти», в 1987 году он возглавил ПО «Когалымнефтегаз» Главтюменнефтегаза Министерства нефтяной и газовой промышленности СССР.
В 1990 году он был переведен из Западной Сибири в Москву, чтобы занять пост заместителя министра нефтяной и газовой промышленности. Год спустя становится первым заместителем министра.
В 1992 году Вагит Алекперов создает «Лангепас-Урай-Когалымнефтегаз» - нефтяной концерн, объединивший месторождения Лангепаса, Урая и Когалыма. В него также вошли несколько нефтеперерабатывающих заводов, в том числе, Пермский и Волгоградский НПЗ.
В 1993 году из государственного предприятия концерн преобразован в акционерное общество, и длинное название заменили на «ЛУКОЙЛ» – по первым буквам названий месторождений. Вагит Алекперов был избран президентом новой компании.
Крупнейшие из значимых для жителей региона проектов, реализованных ЛУКОЙЛом в рамках соглашения с Волгоградской областью: строительство Центра водных видов спорта, детских садов в г. Николаевске и г. Котово, интерактивного музея «Россия – наше будущее», реконструкция стадиона «Темп» г. Волгограда, городского детско-юношеского центра, ремонт больницы № 16 Красноармейского района и других социальных объектов.
В.Ю. Алекперов награжден орденом «За заслуги перед Отечеством» II, III, IV степеней, орденом Дружбы, орденом «Знак Почета», медалью «За освоение недр и развитие нефтегазового комплекса Западной Сибири», орденами Российской Православной Церкви, орденами Республик Азербайджан, Бельгия, Болгария, Казахстан, Узбекистан. Отмечен Почетной грамотой и благодарностями Президента Российской Федерации, Почетной грамотой Правительства Российской Федерации, региональными и ведомственными наградами. Является дважды лауреатом премии Правительства Российской Федерации, лауреатом национальной премии бизнес-репутации «Дарин» Российской Академии бизнеса и предпринимательства. Имеет звание «Почётный профессор Волгоградского государственного университета».