С 1990 по 1993 год – народный депутат РСФСР, Председатель Комитета Верховного Совета Российской Федерации по вопросам обороны и безопасности.
С 1993 по 1998 год на государственной службе: первый заместитель Министра безопасности, директор Федеральной службы контрразведки, директор Федеральной службы безопасности, Министр юстиции, Министр внутренних дел России.
В 1999 году – Первый заместитель Председателя Правительства Российской Федерации – Министр внутренних дел, Председатель Правительства Российской Федерации.
После избрания в декабре 1999 года депутатом Государственной Думы возглавлял Комиссию по борьбе с коррупцией.
В 2000—2013 гг. Степашин С. В. — председатель Счетной палаты РФ, которая под его руководством сформировалась как важный конституционный орган государства.
В 2002–2005 гг. – Президент Европейской организации высших органов финансового контроля (ЕВРОСАИ).
С 2007 года – член Управляющего совета Международной организации высших органов финансового контроля (ИНТОСАИ).
Счетная палата под руководством С.В. Степашина сформировалась как важный конституционный орган государства, обеспечивающий единую систему внешнего финансового контроля за исполнением федерального бюджета и бюджетов государственных внебюджетных фондов. По его инициативе образована Ассоциация контрольно-счетных органов Российской Федерации, проводится целенаправленная организаторская и методологическая работа по дальнейшему развитию и углублению сотрудничества с контрольно-счетными органами субъектов РФ; налажено взаимодействие Счетной палаты с Генеральной прокуратурой РФ, органами государственной безопасности, правоохранительными и иными органами, с которыми проводятся совместные контрольные мероприятия; осуществляются практические меры по обеспечению гласности и открытости результатов контрольной деятельности для широкой общественности.
При активном участии С.В. Степашина создана правовая база для качественно нового уровня сотрудничества Счетной палаты с высшими органами финансового контроля зарубежных государств. В результате деятельности Счетной палаты в стране отмечается положительная тенденция снижения нарушений законодательства в финансово-бюджетной сфере.
С.В.Степашин - доктор юридических наук (в 1994 году защитил диссертацию по теме «Теоретико-правовые аспекты обеспечения безопасности Российской Федерации»), профессор, кандидат исторических наук. Владеет английским языком.
Государственный советник юстиции Российской Федерации. Воинское звание – генерал-полковник.
Награжден орденом «За заслуги перед Отечеством» IV степени в 2012 году, орденом «За заслуги перед Отечеством» III степени в 2002 году и орденом «За заслуги перед Отечеством» II степени в 2007 году, орденом Мужества, медалями «За отличие в воинской службе» I и II степени, «За отличную службу по охране общественного порядка», Орденом «Славы и Чести» I степени, Орденом преподобного Серафима Саровского I и II степени, Командор ордена Почетного легиона (Франция), Командор 1 класса ордена Полярной звезды (Швеция), Золотой медалью М.М.Сперанского, медалью П.А.Столыпина II степени и др.